يعتبر وادي دوعن من أهم و أكبر وأشهر أودية حضرموت، وينقسم إلى قسمين هما : وادي دوعن الأيسر و وادي دوعن الأيمن، واللذان يلتقيان ليصبا في وادي دوعن ، الذي يصب في الوادي الرئيسي، كما يشتهر وادي دوعن بإنتاج العسل الدوعني ذائع الصيت، ويعتبر أغلى أنواع العسل في العالم.

القرى التابعة لها

حريضة:

تقع حريضة عند مدخل أحد الأودية الفرعية لوادي حضرموت وهو وادي عمد، وتبعد عن سيئون مسافة 155 كم باتجاه الغرب، بنيت على أنقاض مدينة مذاب إحدى مدن مملكة حضرموت القديمة وهي حاليا مركز مديرية دوعن، يوجد بالقرب منها في الجهة الغربية آثار معبد الآلهة سين الآلهة الرئيسية في مملكة حضرموت القديمة.

الهجرين:

أقدم قرى وادي حضرموت، وتقع مدينة الهجرين إلى الجنوب الغربي من مدينة سيئون على بعد نحو 100 كم، وتعتبر قرية الهجرين واحدة من من أجمل القرى عامة وأجمل قرى وادي حضرموت خاصة، ولقد أقيمت على مرتقع صخري يشرف على مدخلي الوادي الأيمن والأيسر، وتشتهر هذه المدينة بكثرة مساجدها قياسا بمساحتها إذ تحتوى على عشرة مساجد

ريبون الأثرية:

تقع أطلال و مدينة ريبون إلى الجنوب الغربي من مدينة سيئون ، وعلى بعد نحو 94 كم أسفل وادي دوعن ،وتعتبر من أقدم المدن التاريخية في وادي حضرموت وتشكل أطلالها عدة تلال أثرية، وأعداد كثيرة من شبكات الري المتفرقة في عدة أماكن تزيد مساحتها على 10 هكتار، يعود تاريخ هذه المدينة إلى ما قبل القرن السابع قبل الميلاد.

المشهد:

تقع قرية المشهد على بعد نحو 90 كم إلى الجنوب الغربي من مدينة سيئون، أول من حل وأستقر بها الأديب على بن حسن العطاس سنة 1160هـ وارتبطت باسمه، وأبرز معالم القرية قباب العطاس الثلاث، كل واحدة منها عبارة عن ضريح مربع تقريباً تقوم عليه قبة غير مرتفعة، وفي داخل هذا الضريح القبر.

هدون:

هي قرية صغيرة في وادي دوعن، وتبعد عن سيئون نحو 147 كم وأهم معالمها ضريح هادون عليه السلام ابن النبي هود عليه السلام.